《钢铁神兵》讲述由机械皇帝建立的机械皇国的故事(12)

"小丑"贾古拉的设定不同
漫画版是个本性善良的笑面人，由于生来扭曲的脸导致其性格也扭曲了，从不脱下的面具是为了掩盖他复杂的性格，对于他可笑的真面目，只有娜夏和铁兵没有嘲笑他，陷入濒死边缘的他接触到娜夏的温柔后洗心革面，打开东龙门引导铁兵进入基地，最后一人迎击追踪而来的留加旺部队。动画版是彻头彻尾的反派。
魔将人数不同
动画起初设定为七魔将，但是OVA改设定为四魔将(实际出场的只有密斯林、库亚多罗、冥梦三个人);漫画版为七魔将(密斯林、库亚多罗、冥梦、莎乐美、沙法亚、鲍伊、凯)。
冥梦的设定不同
漫画中，冥梦是北斗自幼失散的哥哥昂，在儿时因为皇国战士的诱骗而误发射出核子弹摧毁了自己的家园，震惊之下因过度自责和悲恸而丧失了记忆，成为魔将，但北斗并不知道冥梦是自己的大哥，漫画中，冥梦最终被北斗击倒，临死前恢复记忆与北斗相认。 动画里，冥梦则与北斗毫无关系，仅是一名普通魔将，最终被铁兵击败。
阿拉密斯的设定不同
漫画中阿拉密斯只是皇国收养培训的孤儿之一，和龙颇有渊源。后来怀著无限的悔恨舍身攻击拉法尔，结果和萝斯玛丽一起死于已成为全形的拉法尔之手。动画版中有一个隐藏的身份-玫瑰骑士，常常说她有一个大使命要完成，而她就是为了完成这个使命才进入机械皇国，对铁兵及四灵将前进到皇国主塔和消灭拉法尔都有帮助，可是在最后一战前却离开皇国，"执行任务"去了，要做什么却全无交待。
结局不同
《钢铁神兵》动画海报动画结局:那个被丢在修罗地狱里的拉法尔的细胞最终成长为第2只拉法尔，吃掉了正在破坏机械王国的拉法尔，破坏了整个机械王国，脱掉无用的碎片，并试图与机械王国保存在系统里的那个建立机械王国的皇帝的意识相结合。最后怪物拉法尔入侵计算机，而且成长到了可以吞食整个地球的恐怖状态，四灵将、铁兵与拉法尔展开斗争，但毫无成效。另一方面，铁兵的哥哥钢太郎终于研究出来，拉法尔的弱点就是怕光!钢太郎冒着生命的危险将太阳的种子送给铁兵。最终战斗画面改为俯视，画面以拉法尔为中心，4灵将分别从东南西北4个方向以红黄蓝绿4种光芒冲向拉法尔，而铁兵从正上方挥舞着"光芒之拳"给与拉法尔最后一击，这时候，场面一片白光……接着画面转到一个教堂，华连妹妹华梨坐在教堂里(凤那个教堂)，身边坐着一群孩子，华梨手持一本像故事书一样的厚本子，在给孩子们讲故事，她说的是勇者铁兵(无法从这句话中判断出铁兵他们的生死。