那段被“去吧，皮卡丘！”召唤的时光，回来了！(5)

它在远离人烟的尼贝尔高原上和被人类伤害过的宝可梦们共同生活，对人类充满敌意。
本来波尔凯尼恩对小智一行人是完全不信任的，也不想与其为伍，但因神秘力量将波尔凯尼恩与小智紧紧的捆绑在一起，无奈之下只能随小智一行人前往阿佐特王国。

阿佐特王国是一个超级机械的城市，大臣贾维斯通过多年研究发明了一款人造宝可梦，玛机雅娜。
玛机雅娜的身体内隐藏着危及阿佐特王国的未知神秘力量“魂心”。加入的科技元素让影片充满现代感，人类与机器的转换对人性有新的思考。
贾维斯企图利用该力量支配阿佐特王国，人类和宝可梦的战役即将打响。

被紧紧相连的波尔凯尼恩和小智，无奈之下同仇敌忾，合力拯救玛机雅娜以及高原上的宝可梦们。
至于玛机雅娜身上的隐藏神秘力量也爆发着极大的危机。这部又结合现代科技的动画大电影除了经典的人物角色之外，更是为我们展现一场召回童年的神奇之旅。