当邓肯再次回到总决赛时，已经是2003年了，这是他最巅峰的时代。(3)

2003年是邓肯职业生涯的分水岭之一。在这之前，他虽然低调，但毕竟“天生丽质难自弃”。作为机动性极强的大前锋，少不了上演各种大片式的面筐运动和飞天暴扣。到了2003年，他渐渐转向后来那标志性的沉稳厚重，但年轻时的轻捷锐利仍然不失。
到了2005年，马刺变得端凝厚重，气象万千，邓肯在内恒定如山，帕克和吉诺比利在外翻云覆雨。他们精密得就像一台机器，每一个零件都经过精雕细琢。
在这一年的总决赛中，邓肯在禁区独自对抗活塞的双华莱士，成就了吉诺比利一代鬼才的名声;邓肯场均20 14的数据，虽然命中率低到40%，但马刺却在七场比赛中笑到最后，邓肯也得以再度举起总决赛MVP。

2007年，邓肯打出最后一个从常规赛坚挺到总决赛的精英赛季，整个季后赛场均22 12，命中率51%。
在总决赛中，他坐镇禁区阻挡帝姆斯的飞天坦克式火力，封盖、收集篮板长传、从骑士的三人夹击中分球助攻、淡定地看着帕克像跑车一样把骑士外线全部累脱水。当帕克举起总决赛MVP时，邓肯无比自然地站到了镜头之外。
从2005年起，邓肯就已经到了一种随心所欲不逾矩的境界，只要他愿意，他可以成为球队的得分王、篮板王、助攻王、盖帽王。
2006 年前的牛马大战，在马刺1比3落后之后，几乎就是他不可阻挡的一对一单打把大比分拉了回来。他在第七场砍下40分、15个篮板，几乎带走胜利。
2007年之后，邓肯在进攻端的单打能力开始钝化，慢慢成为一个依赖挡拆分球的跳投手。
这是马刺的命运所在一-邓肯，21世纪前十年鲨鱼之外最具统治力的巨人，在2007年之后逐渐失去了强大的近筐威慑力，马刺那个距离篮筐最近的利器开始钝锈了。