维吾尔族音乐史诗《十二木卡姆》诞生记，叶尔羌吞并东察合台汗国(5)

至此，叶尔羌汗国的疆土东至嘉峪关，与明朝为界。南面以昆仑山，阿尔金山为界；西面以喀喇昆仑山为界，与西藏的拉达克，博洛尔相邻；西面包括了整个帕米尔及希瓦和瓦罕地区，与莫卧儿帝国相邻；北面与哈哈萨克，吉利吉思，卫拉特相邻。
汗国疆域囊括了今天新疆南部所有地区及甘肃和中亚塔吉克斯坦部分土地。
阴影
在一片形势大好中，日后给汗国带来无尽灾难的隐患也在慢慢形成，这个隐患便是伊斯兰教苏菲派一支的纳克什班底教派分裂成势不两立的黑山，白山二派。