医生提醒：大多数囊肿无需处理，如果囊肿出现在3个地方，要警惕(2)

而对于子宫内膜异位症所导致的巧克力囊肿，也有可能造成不孕症，因为子宫内膜异位症本身是造成不孕症的重要因素。
而巧克力囊肿又会破坏卵巢组织，甚至可能引起卵巢性不孕症，而卵巢的炎性肿物除造成继发性的不孕症外，还有一定恶变的几率，因此，对于卵巢囊肿的女性患者要密切的随访和观察。

胰腺囊肿
胰腺囊肿有真性和假性两种，其中以假性最多见，真性少见，胰腺囊肿如果是真性囊肿且胰腺的囊肿比较小的话，是不需要处理的定时观察就可以了，至少每年检查一次B超，但是胰腺假性囊肿是一定要处理的，特别是比较大的囊肿一定要积极的处理。
囊肿内部发生感染，如果严重的感染会发展成脓肿，患者会产生严重的腹痛症状，甚至会引发败血症发生。
由于胰腺囊肿急剧增大，囊肿穿孔到胃肠道部位，少数患者会产生大出血症状，严重者可引发死亡。
胰腺囊肿极容易压迫到患者的邻近器官，从而引发黄疸等症状，如果囊肿压迫到胰管，则导致胰液排出受到阻碍，大囊肿则会压迫到胃肠道，导致食物通过时形成障碍。
囊肿与胸腹腔形成瘘管时，促使患者产生胰性腹水及胸水症状，发生感染的囊肿极容易向腹腔内部破裂，形成弥漫性的腹膜炎，严重时可危及患者生命。

肝囊肿
肝囊肿是较常见的肝脏良性疾病，本病常多发，可以分为寄生虫性和非寄生虫性肝囊肿，非寄生虫性肝囊肿，是常见的良性肿瘤，又分为先天性、炎症性、创伤性。
临床上先天性肝囊肿比较多见，往往由胚胎时期胆管发育异常所造成，小部分的肝囊肿由创伤和炎症所致。