生物信息学必备网站大全(22)

2023-04-30 来源:飞速影视
GIB,日本DDBJ设立的Genome Information Broker for microbial genomes 的缩写
http://mol.genes.nig.ac.jp/gib/
MAGPIE测序计划清单也可以参考
http://www-fp.mcs.anl.gov/~gaasterland/genomes.html
EMGLib,增补微生物基因组库
http://pbil.univ-lyon1.fr/emglib/emglib.html
大肠杆菌K12菌株的完全基因组序列,可由GenBank的子目录/genomes/获取,或从华盛顿大学大肠杆菌基因组中心,即Blattner实验室的网页读取:
http://www.genetics.wisc.edu/pub/sequence/
ECDC,大肠杆菌菌株K12的基因序列库,包括基因、读框、调控区、启动子、终止子、tRNA和rRNA等
http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc/ecdc.html
ftp://ftp.ebi.ac.uk)/pub/databases/ecdc)
EcoGene和EcoWeb,大肠杆菌K12菌株基因组数据库,包括基因、蛋白质、基因间蛋白质组信息
http://bmb.med.miami.edu/EcoGene/EcoWeb/
RegulonDB,大肠杆菌转录调控和操作子数据库
http://www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/
NRSub,非冗余枯草芽孢杆菌DNA数据库,包括完全基因组、密码子使用表、基因图谱和基因家族
http://acnuc.univ-lyon1.fr/nrsub/nrsub.html
ftp://ftplnig.ac.jp(/pub/db/nrsub)
HIDB,流感嗜血菌完全基因组的原始数据库
http://www.tigr.org/tdb/mdb/hidb/hidb.html
ftp://ftp.tigr.org/pub/data/h_influenzae
HIDC,流感署血菌基因序列库
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