岸本其实最钟爱的忍者不是佐助、鸣人，而是他(3)

多年后，晓组织得到了一个重要的消息大蛇丸入侵木叶，而三代目火影死了，为了确保木叶高层能继续履行当时保护自己弟弟的约定，鼬和鬼鲛一同前往木叶，却被卡卡西发现，在与木叶一众上忍发生过摩擦后，鼬以不想此时发动战争为由离开了，他提醒木叶高层的目的已经达成。
之后鼬又去见了自己的弟弟，他看到佐助安然无恙的样子十分欣喜，但却只是二勾玉的写轮眼，他怕自己并不能撑到佐助开启万花筒写轮眼，于是用月读继续刺激他，让他开启三勾月玉，可佐助只是晕了过去，此时自来也来了，鼬不想与其交战，便用天照逃离了出去。
佐助在见过鼬之后复仇迅速填满了大脑，为了得到力量，离开了村子，投奔了大蛇丸。
之后在大蛇丸的指导下，佐助掌握了天之咒印的使用，杀死了大蛇丸，并创立了“蛇”小队，去寻找鼬复仇，此时木叶也派出了鸣人一众开启了第二次佐助夺回行动，在寻找佐助的过程中，鼬遇到了鸣人，在确定了鸣人对佐助的感情之后将带有“守护木叶”幻术的别天神给了鸣人，并使别天神的触发设置为看到自己的万花筒写轮眼后触发。之后便是与佐助的决战。

此时在宇智波家族的据点，鼬的万花筒写轮眼快要失明，但他还是强撑着与佐助战斗，两个人从体术、幻术、忍术进行了十分激烈的战斗，当佐助用最后的绝招麒麟，却被鼬的须佐能乎挡掉之后他的身体便不受控制，被它吞噬的大蛇丸从他体内钻了出来，并发动了八岐大蛇之术，却被鼬的十拳剑所封印，至此鼬所有的目标都已达成。
他死后所看到的木叶是佐助回归村子，能继续和平的生活，复兴宇智波一族。但是，带土将所有的真相都告诉了佐助，佐助加入了晓，开启了对木叶的复仇。
在之后的第四次忍界大战中，鼬被兜所复活，与长门一起碰到了鸣人，于是之前施加在鸣人身上的别天神被用在了他身上，解除了秽土转生对鼬的控制，在他与鸣人一起封印长门后，鼬独自前往去阻止药师兜。
在前往的路上，鼬碰到了佐助，此时的佐助已经知道了真相，知道了自己多年来一直恨错了对象，但对鼬欺骗他一直耿耿于怀。