图书馆战争：为了保护书籍一个个倒下，这部动漫出乎意料的燃

故事的背景选择设置在一个架空世界的日本社会，当时的政府以维护民众不受媒体的恶意教化为由，制定了“媒体良化法”来杜绝青少年有害或是侵害人权的相关媒体，并且成立了“媒体良化委员会”，以及具体执行检阅工作的“良化特务机关”。

这些人有权没收或是禁止一切被认为有危害嫌疑的物品，甚至在遭遇抵抗的时候还可以使用武力逼其就范，这也导致媒体与资讯流通受到极大的拘束。随着这样压迫言论的现象越演越烈，为了保护人类最基本的自由权利，此时出现了一群人以图书馆为根据地，组成了独立性的防卫组织，也就是“图书队”。

他们根据所制定的图书馆自由法，让其能持有一定的武装能力去抵抗良化机关的侵袭，于是在两者强碰的情况下，冲突事件也越来越严重。而就在这诡异的社会气氛中，身为女主角的笠原郁加入了图书队，并在直属教官也是身为男主角的堂上笃的带领下，展开了一段保护书籍的故事。