《黑客帝国》是一部克苏鲁式机械神，支配地球的科幻动作片(2)

如果Zion是虚拟的就很简单了，人类自己编写的模拟程序是很不完善的，一些漏洞影响到了上层的Zion代码，所以使Zion里的代码产生了损伤，造成了出血效果。
相比之下Zion只需要一个光秃秃的大地，上面全是机械。模拟机械行为和模拟生物行为代码量和运算量绝对差了N个数量级。

恐怕模拟一只爬行动物的意识反映和全身的生化代谢的量已经足够跑起整个Zion地表了。
Zion每次毁灭肯定是整个服务器重启了并重新初始化了，否则凭借救世主带出的那15个人重建Zion可能性是很低的。
Smith想要脱离矩阵以至于摧毁矩阵来达成自己的"自由"！
所以他开始疯狂复制，他的"附体"就是把自己复制到了第二层矩阵中Zion里人的意识而已，因为自然人的意识在矩阵中也只是程序，所以被Smith病毒感染。

但是Smith在第二层矩阵中只是复制了一部分（可能权限不够）。
当他控制了整个矩阵后，把所有的人都复制成自己，自认为设计师定位不到他从而无法消灭他，但他不知道Neo在摧毁他的部分代码时与他相关联了。
所以Neo被设计师接入矩阵后，Smith不敢打死他，因为他们现在是一体的了！Smith只能感染他，从而被设计师定位并消灭掉。再者，关于为什么会看到黄金代码的问题。