南少林寺1100年间三兴三废，乾隆爷下令焚毁，黄飞鸿为南少林拳王(4)

少林武僧，泉州抗倭
嵩山少林寺德虔法师《少林武僧志》（北京体院出版社，1988年）称：“《少林寺内传》载，垣然和尚武功超群，受到（明）嘉靖皇帝（1522—1566年在位）的嘉奖。当年垣然和尚的高足月空法师曾受命带领30多个打出山门的武僧，到福建泉州抵抗倭寇立功，并在那里建立一座南少林寺，做了该寺的方丈。”
时至今日，闽南仍流传着北少林武僧平倭的故事。

乾隆焚寺、黄飞鸿传播少林拳
清乾隆年间，乾隆下江南，担心南少林武僧与郑成功（参见《泉州人名录·郑成功》）的党羽勾结，“乾隆二十八年（1763年）秋诏焚少林寺……从兹无复敢修者。”部分寺僧避于南安一片寺。此为泉州南少林寺第三次被毁。
火烧少林寺之后，少林寺和尚至善法师避祸民间，继续招收少林弟子，反清复明。至善、洪熙官及其弟子传至广东，继续发展南少林拳，出了南少林拳王黄飞鸿,后又由黄飞鸿弟子传至香港，并远播美国等。

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早年的泉州南少林寺建筑众多、地界庞大；东至东岳山麓，西至东门护城河，南至东湖，北至伊斯兰墓地。现存的东禅少林寺仅是宋时期泉州南少林寺的一小部分。
重修的泉州少林寺是根据北宋文献的记载而复建，有牌坊、正山门、南山门、天王殿、大雄宝殿、方丈楼、演武堂、观音阁、藏经阁、钟鼓楼、五观堂等。