生物信息学必备网站大全(11)

PLACE是从文献中搜集的植物顺式作用调控元件DNA模体的数据库,只涉及维管植物.
http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/PLACE/
ftp://ftp.dna.affrc.go.jp(/pub/dna_place/place.seq)
Mendel数据库,搜集植物STS和EST序列.
http://jiio6.jic.bbsrc.ac.uk/
HOX Pro同源异型盒(homeobox)基因数据库.
http://spirov.iephb.nw.ru/hox_pro/hox-pro00.html
OPD,寡核苷酸探针数据库(Oligonucleotide Probe Database).
http://www.cme.msu.edu/OPD/
dbSTS,序列标记位点(Sequence Tagged Sites)数据库.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS/
ftp://ncbi.nlm.nih.gov(/repository/dbSTS)
dbEST.这是GenBank的重要组成部分,它包含若干物种的已表达的序列标记信息.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/
ftp://ncbi.nlm.nih.gov(/repository/dbEST)
AmmtDB,后生动物线粒体DNA多序列联配数据库,搜集了脊椎动物线粒体中编码蛋白质和tRNA的多DNA序列对比数据,以及哺乳动物mtDNA主调控区序列联配数据.
http://bio-www.ba.cnr.it:8000/BioWWW/#AMMTDB
HOVERGEN,脊椎动物同源基因数据库(HOmologous VERtebrate GENes)
http://acnuc.univ-lyon1.fr/
ftp://ftp.infobiogen.fr(/pub/db/acnuc/hovergen)
DNA结构参数库.
ftp://transfac.gbf.de(/pub/structure_library)
NUCLEOSOME数据库,收集实验测定的核小体数据,用于预测DNA中与组蛋白八聚体结合的位点.