生物信息学必备网站大全(9)

2023-04-30 来源:飞速影视
1. 数据库目录
2. 综合数据库包括DNA序列阵:EMBL、GenBank、DDBJ、GSDB、TDB和UniGene
3. DNA序列数据库主要是与基因结构和认定有关的数据库,如密码子使用频度表、真核生物启动子库、内含子和外显子库等
4. RNA序列和核糖体数据库
5. 基因图谱数据库
6. 人类基因组数据库
7. 其他物种基因组数据库
8. 基因表达数据库
9. 基因突变、病理和免疫数据库
10. 蛋白质序列数据库
11. 蛋白质结构数据库
12. 比较基因组学和蛋白质组学数据库
13. 代谢途径和细胞调控数据库
14. 与农林牧有关数据库
15. 医学数据库
16. 其他数据库
二.综合数据库
INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence Databank)由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护
EMBL库,欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库
http://www.ebi.ac.uk/embl.html
GenBank ,美国国家生物技术信息中心 (NCBI)所维护的供公众自由读取的、带注释的DNA序列的总数据库
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Genbank/
DNA Databank of Japan (DDBJ) ,日本核酸数据库
http://www.ddbj.nig.ac.jp/
GSDB是由美国国家基因组资源中心(NCGR)维护的DNA序列关系数据库(Genome Sequence DataBase)
http://www.ncgr.org/gsdb/
TIGR DATAbase,是世界上最大的cDNA数据库,还有大量的EST序列和人类基因索引(HGI)
http://www.tigr.org/tdb/hcd/overview.html
三.DNA序列和结构数据库
包括与DNA的复制、转录、修复等有密切关系的蛋白质因子
BioSino是中国自主开发的核酸序列公共数据库
http://www.biosino.org/
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