生物信息学必备网站大全(30)

2023-04-30 来源:飞速影视
PDB at a Glance清单
http://cmm.info.nih.gov/modeling/pdb_at_a_glance.html
PDBselect数据库
http://swift.embl-heidelberg.de/pdbsel/
PDBsum是PDB库中数据的更便于阅读的总结和分析,以及一些衍生数据
http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum/index.html
BioMagResBank简称BMRB,是关于多肽、蛋白质和核酸的核磁共振数据库
http://www.bmrb.wisc.edu/
CSD,剑桥结构数据库
http://www.ccdc.cam.ac.uk/prods/csd.html
NRL-3D,三维结构已经确定的蛋白质序列库
http://www.gdb.org/Dan/proteins/nr13d.html
FAMBASE,,是每个蛋白质家族的代表序列的集合,它有助于加速同源性搜索
http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/fambase.html
ProtFam,蛋白质超家族的序列联配数据库
http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/protfam/protfam/
SCOP,蛋白质结构分类数据库
http://www.ipc.pku.edu.cn/scop/
CATH,蛋白质结构与功能关系分类数据库
http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/
PIR-ALN,蛋白质序列联配数据库
http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/alndb.html
3Dee,蛋白质结构域定义的数据库
http://circinus.ebi.ac.uk:8080/3Dee/
ProTherm,蛋白质及其变异体热力学数据库
http://www.rtc.riken.go.jp/protherm.html
ASTRAL是基于SCOP数据库的一组分析蛋白质结构和蛋白质序列的数据库和工具
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