生物信息学必备网站大全(31)
2023-04-30 来源:飞速影视
http://astral.stanford.edu/
RESID,蛋白质翻译后修饰情况的数据库
http://pir.georgetown.edu/pirwww/search/textresid.html
SMART是简单模块构架搜索工具的缩写
http://SMART.embl-heidelberg.de/
PROMISE数据库
http://bmbsgi11.leeds.ac.uk/bmbknd/promise/MAIN.html
MMDB蛋白质分子模型数据库
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/
VAST矢量联配搜索工具
http://swift.embl-heidelberg.de/dssp/
DSSP,PDB库中所有蛋白质条目的二级结构归属数据库
http://swift.embl-heidelberg.de/dssp/
HSSP,按同源性导出的蛋白质二级结构数据库
http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/
Dali/FSSP,基于PDB数据库中现有蛋白质三维结构,用自动结构对比程序Dali逐一比较而形成的折叠单元和家族分类库
http://www.embl-ebi.ac.ul/dali/
http://croma.ebi.ac.uk/dali/fssp/
3d_ali数据库,搜集彼此相关的蛋白质序列和结构数据
http://www.embl-heidelberg.de/argos/ali/ali.html
DEF蛋白质折叠类的预测数据库
http://zeus.cs.uoi.gr/neural/biocomputing/def.html
INFOGENE,Sanger中心计算基因组学小组维护的、各基因组测序计划所提供的序列中已知的蛋白质和预测出的基因与蛋白质的数据库
http://genomic.sanger.ac.uk/inf/infodb.html
TMBase,跨膜蛋白数据库
ftp://ulrec3.unil.ch(/pub/tmbase)
PRESAGE是关于结构基因组学的一个数据库,它为库中每个蛋白质搜集了反映当前实验状况、结构、模型和研究建议的注释
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