体内微生物环境形成、变化研究(3)

在Segata于2013年在特伦托大学建立实验室后，这种情况发生了变化。他和他的团队开始创建和改进宏基因组学工具，可以区分同一物种的菌株，这使得更详细地研究微生物组传播成为可能。
Segata于2018年开始通过分析母亲及其婴儿的微生物来探索这个问题。Segata说，他的小组的研究结果和其他几项研究证实了早先的怀疑，即从母亲到婴儿的大量传播，以至于母亲“在出生时就印上了微生物组”。最近的研究表明，母亲在几年内继续塑造婴儿的微生物组。
但是微生物组的多样性在童年和成年之间发生了显着变化，因此母亲的早期遗传“并不能解释我们在成年人身上看到的微生物，”Segata说。在后续实验中，研究人员在很大程度上排除了新微生物来自人们吃的食物的可能性，因为这些微生物不能很好地定植肠道。
所以“它必须是传播，”Segata说。“一定是我们肠道中的东西来自其他人的肠道。

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对于微生物组的新的全球分析，Segata，Valles-Colomer和他们的同事磨练了他们的工具，足以识别以前未知的物种和同一物种的不同菌株。他们检查了来自五大洲20个国家的9700多个粪便和唾液样本，代表了生活方式非常多样化的社区，涵盖了人类寿命的全部范围和许多不同的生活安排。他们追踪了家庭、室友、邻居和村庄之间的80多万种微生物，并计算了共享物种中相同菌株的百分比。
正如他们所预料的那样，他们发现在生命的第一年，母亲和婴儿之间发生了最多的菌株共享 - 在婴儿肠道中发现的共享物种中约有50%是从母亲传播的菌株。母亲的影响力随着时间的推移而减弱——从3岁时的27%下降到30岁的14%——但并没有消失。中国的一些老年人被证明仍然与他们幸存的百岁母亲分享压力。
对于梅奥诊所（Mayo Clinic）的免疫学家维娜·塔内贾（Veena Taneja）来说，研究结果中更令人惊讶的花絮之一是，尽管阴道出生的婴儿比剖腹产出生的婴儿与母亲共享更多的菌株，但这种差异在三岁时消失了。她说，“人们从中受益”，通过剖腹产出生的婴儿可能更容易患上某些疾病。但研究结果表明，也许这“不应该是一件大事”。
（本月发表在Cell Host&Microbe上的一项新研究证实了这一观点。研究发现，通过剖腹产出生的婴儿比阴道出生的婴儿接受的母亲微生物组更少，但他们并没有错过，因为他们从母乳中获得了更多的微生物。