CellPress精选：2021世界抗菌药物提高意识周(7)

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结核分枝杆菌的外排泵及其对应对抗微生物抗性的抑制作用

结核病（TB）是由结核分枝杆菌引起的传染病，是2019年全球因单一传染性病原体导致死亡的主要原因。现代抗生素药物无法治疗的结核分枝杆菌菌株带来的威胁越来越大，进一步加剧了这个问题。为了应对这一持续性公共卫生紧急情况，目前比较紧迫的优先事项之一是研究如何增强已获批准的抗菌药物对抗结核分枝杆菌耐药菌株的效果，而这方面的关键策略是设计分枝杆菌外排泵抑制剂（efflux pump inhibitors，EPIs）。来自伦敦国王学院的Khondaker Miraz Rahman、Mark Laws及Peiqin Jin在Trends in Microbiology发表综述文章，总结了结核分枝杆菌外排泵相关药物的研究现状，并介绍了结核分枝杆菌EPIs领域的最新进展，以帮助设计有效的辅助疗法来应对结核病中外排介导的抗药性。
整合性可移动遗传元件的生物信息学分析表明了其在细菌适应中的作用

可移动遗传元件（mobile genetic elements，MGEs）有助于细菌适应与进化，但进行高通量的无偏MGE检测仍然存在挑战。来自斯坦福大学的Ami S. Bhatt团队在Cell Host & Microbe发表研究文章，描述了一个生物信息学工具箱MGEfinder，它可以通过使用短读测序数据来识别整合性MGE及其插入位点。MGEfinder可识别每个MGE插入的基因组位点，并推断插入序列的身份。研究人员用MGEfinder检测了包括结核分枝杆菌、金黄色葡萄球菌和大肠杆菌在内的9种流行细菌病原体的12374个测序分离株，鉴定了数千个MGEs，包括候选插入序列、接合性转座子和前噬菌体元件。MGE谱和插入率因物种而异，整合位点通常聚集在与抗生素抗性、毒力和致病性相关的基因附近。