廓尔喀军入侵西藏，乾隆派大军远征，一举将尼泊尔打成大清附属国(5)

而留守都城的王叔巴哈都尔·沙阿召见被扣押的噶伦丹津班珠尔，请求转告福康安，造成一切的结果皆因沙玛尔巴活佛唆使，保证归还入侵西藏时所掠夺的财物，赔偿清军在冲突中的损失。
6月25日，廓尔喀头人面见福康安，讨论投降事宜。福康安告知廓军使者想要投降可以，必须遵从“廓兵须退出噶勒拉、堆补木、甲尔古拉、集木集等处山梁；廓尔喀王喇纳巴都尔、王叔巴都尔萨野亲自前来；将沙玛尔巴活佛尸骨及其徒弟交出；所掠之扎什伦布寺财宝全行归还；交出乾隆五十四年与丹津班珠尔私订之合同，不得再提西藏交付赎银之事。”后清军将廓军使节送还，7日后尼泊尔国王并没有给予回复，遂下令继续进攻。
7月2日，清军进攻噶勒拉、堆补木。在进攻甲尔古拉山时，廓军引诱清军进入原始森林，后放火烧林，导致清军失利，死伤严重。

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无论廓军怎样抵抗，限于国力的差距，尼泊尔无论如何也无法战胜清军。
8月8日，尼泊尔使者抵达清军大营，商讨投降的具体细节，并代替尼泊尔的国王、王叔到北京觐见。
8月19日，福康安同意了尼泊尔国王的投降。
9月4日，清军撤兵到回济咙。
清军撤兵后，福康安重新勘探西藏与尼泊尔的边境。10月15日，福康安来到拉萨受到达赖喇嘛等众官员的欢迎。
12月23日，尼泊尔使者抵达北京，谒见和珅。
12月24日，使者觐见乾隆皇帝。
经过此次战争，尼泊尔王国的实力受到削弱，在经过一系列商讨后，尼泊尔最终成为大清的附属国。