海上丝绸之路还有另一起点？上海滩也发源于此，却因倭寇日渐式微(7)

《宋史》也记载：“（南宋淳熙）十年，日本七十三人，复飘至秀州华亭县，给常平义仓钱米以振之。绍熙四年，泰州及秀州华亭县，复有倭人为风所泊而至者，诏勿取其货，出常平米振给而遣之。”当时青龙镇属华亭县，又是华亭县最大的海港。对这些为风浪所迫而漂泊至青龙镇的日本人，南宋政府给予了最大程度的友善与慷慨。
青龙镇因水而兴，也因水而衰。南宋末年，由于吴淞江上游泥沙下泻、流速变慢，下游受海潮托顶，使泥沙沉积于河床，以致河流弯曲、排水不畅。再加上当地农民占用水道来种植农作物，使得河底淤泥沉淀，水道变窄。庆历二年（1042年），又在太湖出水口造了一道长堤；庆历八年（1048年）又建了吴江长桥，使得江流减慢、下游诸港浦淤塞。
如此种种，使得吴淞江航道越来越窄。到南宋末年，大型商船终于再无法抵达青龙镇港口。与此同时，位于青龙镇东、吴淞江下游的上海镇渐渐兴盛了起来，逐渐取代了青龙镇港口的地位。人流物流不再聚集，青龙镇的繁华随之远去。
元末明初，土匪横行，已经日渐衰败的青龙镇还是难逃厄运，惨遭洗劫，嘉靖年间更是遭到倭寇焚烧掳掠，房屋、寺院损毁严重。到这个时候，青龙镇往日门庭若市的繁华景象终于彻底远去。