肿瘤分子分型｜Cell最新重磅：精准肿瘤治疗的下一个地平线(2)

在这篇形象化的图中，蛋白基因组在精确肿瘤学中的作用由一位展望未来的癌症患者来说明。他的视野由DNA和RNA山丘(基因组学)和蛋白质云(蛋白质组学)所构成，它们共同代表了克服科学山丘的关键。强烈的阳光体现了基因组学目前对肿瘤学的贡献，为患者肿瘤的多组学分子表征之旅的下一步指明了道路。病人期待着一个更光明的前景，一个基因组和蛋白质组分子诊断被结合到临床试验和病人护理中的前景，一个病人和家人被赋予希望的前景。
主要内容
一、精确肿瘤学 :基因组学和TCGA没有人类基因组测序的重大成就，精确肿瘤学不会存在。人类基因组计划完成不到三年后，美国国立卫生研究院正式启动了一个先期计划，致力于创建一个癌症相关基因组变化的综合目录——TCGA。TCGA系统地描述了数量空前的注释良好的人类肿瘤样本及其匹配的正常组织(来自33种肿瘤类型的大约11,000个病例)，包括9种罕见癌症，产生了癌症研究界继续挖掘的大量数据，以确定可能在致癌表型中起作用的基因组变化。TCGA为理解癌症的起源和原因铺平了新的道路，并提出了所分析的癌症中的驱动基因。此外，它通过将基于证据的肿瘤分类转化为分子定义的分类，改变了诊断前景，这可能使患者的治疗比以前更加精确。这些变化可能最终允许通过对患者治疗进行分层，来开发具有更高成功概率的临床试验。尽管取得了这些进步，但在我们识别基因组变体、将它们与调节元件联系起来，以及理解这些分子异常如何影响人类癌症(将基因组变体与人类表型联系起来)的能力方面，仍然存在连接的鸿沟。
二、精确肿瘤学 :基因组学的空白，应用和临床转化的挑战即使靶向药物与特定突变匹配良好，也不总是有效的。例如，尽管美国食品和药物管理局批准了多种激酶抑制剂用于治疗各种形式的癌症，但患者之间的反应仍然存在差异，包括当患者具有相同的基因组异常和癌症类型时。在无法有意义地解释基因组特征对特定患者肿瘤生物学的贡献的情况下，医生会发现自己在癌症患者可用的治疗手段方面受到限制。这些距离将精确肿瘤学置于十字路口。