一区顶刊：国家肝癌中心用多组学技术解析双阳性细胞轨迹和特征(2)

研究结果
1.肝细胞癌主要免疫谱系的空间异质性
作者首先对来自肿瘤核心（T）、非肿瘤区域（N）和前沿区域（L）的 39 个匹配组织标本进行了大规模的大规模细胞免疫分析（图1A），免疫谱系的分布在 tSNE 图中可视化（图 1B）。观察到HCC中T细胞的数量从N区逐渐减少到T区，而B细胞的趋势相反；观察到几个 T 细胞亚簇在 L 区域显著富集（图 1B），在来自不同区域的不同免疫细胞谱系中观察到表面标志物的多样化表达模式（图 1C，D）。这些结果表明，HCC中的免疫微环境在空间上是异质的。

图1 | 肝细胞癌主要免疫细胞谱系的空间异质性
整个工作流程的图形摘要。提取手术切除的样本中的免疫细胞并用金属标记的抗体进行处理，然后进入飞行时间质谱流式细胞仪管道。获得的数据在降维后可视化。通过手动门控策略和聚类算法识别细胞簇。T指肿瘤核心区；L 指前沿区域；N指非肿瘤区域。
2.T细胞簇呈现区域多样性并在L区域显示出独特的特征
为了探索三个区域中不同的 T 细胞亚群组成，作者可视化并重新分析了 T 细胞亚群。通过应用 FlowSOM 算法，可以将 T 细胞划分为 40 个簇（包括来自三个区域的所有 T 细胞）（图 2A ）。然后，作者首先将 40 个集群分类为经典的 T 亚型。发现 CD4 效应记忆 T 细胞 (Tem) 从 N 到 L到 T区域逐渐增加，而 CD8 Tem 则呈现相反的趋势 （图 2B）。图表根据面标记的代表性表达模式（图 2D，E），发现几个富含T的T细胞簇（8, 7, 3, 2, 1）表现出衰竭状态，PD-1水平高，HLA-DR表达低，许多富含 N 的簇 (39, 33, 32) 表现出 PD-1/HLA-DR 低表达和 CD45RA 表达增加的静止状态。
作者注意到，在 13 名 HCC 患者中，至少有 8 名（>61%）的 L 区富含 DPT 细胞。此外，作者还观察到 DPT 簇与簇 21、16、26、12、15 和 11 之间的强表型相关性，它们都是 CD28 T 细胞。