一区顶刊:国家肝癌中心用多组学技术解析双阳性细胞轨迹和特征(6)

2024-09-26 来源:飞速影视
虽然血液和外周淋巴组织中的 DPT 细胞已被广泛研究,但它们在癌症中的分子特征和细胞功能尚不清楚。CD45RO 和 PD-1 的共表达在 DPT 细胞中最高,其他免疫衰竭标志物(TIM3 和 CTLA-4)在 DPT 细胞中的表达也略有增加。
对单个阳性 T (SPT) 细胞进行了 scRNA-seq 分析,包括 3676 个肿瘤相关 CD4T 细胞和 4470 个 CD8 T 细胞。CD4T 细胞和 CD8T 细胞分别分为五个和六个簇(图 6A、B)。作者分析了 DPT 细胞簇和 SPT 细胞簇之间的转录组相似性(特征基因表达的 Pearson 相关性)(图 6C)。
TCR 分析显示,与 PBMC 相比,TDPT 细胞与 TCD4 和 TCD8 共享更多的 TCR 克隆,表明肿瘤相关 DPT 细胞最有可能从肿瘤内 SPT 细胞转化(图 6D)。进一步发现 DPT 细胞主要与 CD8T 细胞共享高频 TCR 克隆(图 6E)。在 DPT/SPT 的 UMAP 上预测了频率最高的前六个 TCR 克隆(图 6F)。
通过应用多重免疫荧光组织染色,作者还观察到 PD-1CD8SPT 细胞在空间上比 PD-1 CD4 SPT 细胞更接近 PD-1 DPT 细胞,而在 PD-1 中没有发现这种差异- DPT 细胞(图 6G,H)。总之,作者的数据描绘了 T 细胞的表型发育路径,并表明 PD-1DPT 细胞来源于肿瘤内 CD8 T 细胞,而不是胸腺中的 PD-1 CD4或幼稚 T 细胞。

一区顶刊:国家肝癌中心用多组学技术解析双阳性细胞轨迹和特征


图6 | 肿瘤相关的 DPT 细胞来源于浸润的 SPT 细胞
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免疫微环境在不同癌症之间表现出高度异质性,在不同个体之间表现出高度多样性。对人类肿瘤中不同免疫成分的密度、位置和功能的探索导致了关键原癌和抗肿瘤免疫特征的鉴定。各种肿瘤的组织病理学分析证实,浸润的免疫细胞在肿瘤及其周围非肿瘤区域内的分布存在很大差异。肿瘤细胞和相邻基质细胞之间的串扰已被确定为肿瘤进展的重要驱动因素。基质诱导的炎症和血管生成已被证明具有促进肿瘤的作用。
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